![\"Cientista](\"https:\/\/blogmed.antonini.com.br\/wp-content\/uploads\/2023\/05\/cientista.png\")
Cientista lidando com as amostras coletadas no Laborat\u00f3rio de Imunogen\u00e9tica e Histocompatibilidade da UFPR (LIGH). Acervo do Departamento de Gen\u00e9tica.<\/p><\/div>\n
O objetivo principal do projeto foi o de identificar rapidamente as pessoas infectadas pelo chamado \u201cnovo coronav\u00edrus\u201d, possibilitando o isolamento destes indiv\u00edduos como medida para evitar a propaga\u00e7\u00e3o da doen\u00e7a.<\/p>\n
Numa parceria com o Setor de Ci\u00eancias da Sa\u00fade (SCS), com o Setor de Educa\u00e7\u00e3o Profissional e Tecnol\u00f3gica (SEPT) e com a CASA-3 (Coordenadoria de Aten\u00e7\u00e3o Integral \u00e0 Sa\u00fade do Servidor) foi poss\u00edvel implantar um sistema de triagem de casos suspeitos e de coletas de amostras na comunidade da UFPR. As primeiras coletas ocorreram no campus Bot\u00e2nico, em sistema drive thru, com o apoio da equipe do SCS, que realizava a coleta de secre\u00e7\u00f5es nasofar\u00edngeas atrav\u00e9s de swab nasal (cotonete est\u00e9ril inserido pelo nariz). A equipe do Prof. Alexander Biondo (Setor de Ci\u00eancias Agr\u00e1rias) tamb\u00e9m contribuiu no processo de coleta, que logo se mostrou ser um importante gargalo pelo fato de exigir pessoal especializado e disponibilidade de Equipamentos de Prote\u00e7\u00e3o Individual (EPIs). Para otimizar todo o processo, o Prof. Dieval Guizellini, do Setor de Educa\u00e7\u00e3o Profissional Tecnol\u00f3gica, elaborou um algoritmo de triagem e sele\u00e7\u00e3o daqueles que realmente precisavam do exame e criou site de agendamento. O Prof. Edvaldo Trindade, diretor do Setor de Ci\u00eancias Biol\u00f3gicas \u00e0 \u00e9poca, conta que foi uma tarefa muito complexa organizar esta log\u00edstica para triagem e coleta, que contou com grande apoio da dire\u00e7\u00e3o do Setor de Sa\u00fade (pessoal da Farm\u00e1cia Escola), da Pr\u00f3-Reitoria de Gest\u00e3o de Pessoas (PRA) e tamb\u00e9m da Reitoria.<\/p>\n
Com o aumento da procura, uma equipe de duas ou tr\u00eas pessoas mostrou-se insuficiente para atender toda a demanda. A equipe cient\u00edfica do projeto buscou ent\u00e3o pesquisas que apresentassem m\u00e9todos alternativos e possibilitassem aumentar o n\u00famero de coletas sem a necessidade de pessoal especializado. O resultado disso foi a padroniza\u00e7\u00e3o de um m\u00e9todo de coleta de amostras de saliva dos pacientes, mais simples e barato que o m\u00e9todo do swab, e que mostrou-se t\u00e3o eficiente e com a mesma sensibilidade para a detec\u00e7\u00e3o do novo coronav\u00edrus. Al\u00e9m disso, outra vantagem \u00e9 o fato do novo m\u00e9todo se basear numa autocoleta, portanto, pouco invasivo, menos desconfort\u00e1vel e oferecendo menor risco de contamina\u00e7\u00e3o para a equipe.<\/p>\n
![\"Primeiro](\"https:\/\/blogmed.antonini.com.br\/wp-content\/uploads\/2023\/05\/posto-de-coleta.jpg\")
Primeiro posto de coleta montado, ainda no Campus Bot\u00e2nico. Acervo do Departamento de Gen\u00e9tica.<\/p><\/div>\n
\u201cPod\u00edamos montar 15 postos de coleta, onde cada pessoa coletava a sua pr\u00f3pria saliva pelo canudinho. N\u00e3o precis\u00e1vamos de um grande n\u00famero de profissionais de sa\u00fade especializados e capacitados para fazer a coleta, como seria se estiv\u00e9ssemos fazendo por swab\u201d, explica a Profa. Jaqueline Carvalho de Oliveira, uma das respons\u00e1veis pelo projeto. Assim, a mudan\u00e7a de m\u00e9todo acarretou redu\u00e7\u00e3o de custos e mudan\u00e7a de local e estrutura de atendimento, passando a acontecer no estacionamento do SCB.<\/p>\n
![\"Posto](\"https:\/\/blogmed.antonini.com.br\/wp-content\/uploads\/2023\/05\/posto-de-coleta-2-1024x767-1.jpg\")
Posto de coleta no estacionamento do Setor de Ci\u00eancias Biol\u00f3gicas (SCB). Acervo do Departamento de Gen\u00e9tica.<\/p><\/div>\n
Feita a coleta das amostras, a execu\u00e7\u00e3o dos exame era inicialmente manual, sem nenhuma automatiza\u00e7\u00e3o, j\u00e1 que n\u00e3o havia equipamentos para testagem em larga escala, o que limitava o n\u00famero de testes di\u00e1rios. Com a chegada de um extrator autom\u00e1tico de RNA viral, o resultado passou a ser entregue em at\u00e9 48 horas e foi poss\u00edvel ampliar ainda mais os atendimentos. \u201cA maioria dos resultados eram entregues antes de 24 horas. At\u00e9 nos mutir\u00f5es, com um grande n\u00famero de amostras, nosso resultado sempre foi o mais r\u00e1pido da cidade\u201d, orgulha-se a Profa. Daniela Gradia, tamb\u00e9m uma das respons\u00e1veis pelo projeto. A partir de novembro de 2020, a UFPR passou a organizar mutir\u00f5es para atender tamb\u00e9m a comunidade externa e pessoas assintom\u00e1ticas. A equipe chegou a realizar 2 mil exames em um \u00fanico dia.<\/p>\n
![\"Douglas](\"https:\/\/blogmed.antonini.com.br\/wp-content\/uploads\/2023\/05\/Douglas-Adamoski-1024x534-1.jpg\")
Douglas Adamoski manuseando o rob\u00f4 que faz a extra\u00e7\u00e3o autom\u00e1tica de RNA viral das amostras. Acervo do Departamento de Gen\u00e9tica.<\/p><\/div>\n
No per\u00edodo, foram realizados exames para v\u00e1rias institui\u00e7\u00f5es, incluindo internos e funcion\u00e1rios do Departamento de Pol\u00edcia Penal do Estado do Paran\u00e1 (DEPEN), Pol\u00edcia Militar, popula\u00e7\u00e3o de rua, comunidades isoladas e institui\u00e7\u00f5es p\u00fablicas de ensino. O Hospital de Cl\u00ednicas (HC) tamb\u00e9m foi atendido pelo projeto: a equipe de servidores do hospital, que precisava ser testada regularmente para garantir a seguran\u00e7a no local, era rotineiramente testada pelo servi\u00e7o, uma vez que a alta demanda de pacientes na \u00e9poca, com muitos leitos extras e adaptados, impedia que os servidores fossem testados no pr\u00f3prio hospital.<\/p>\n
Foram 13 mutir\u00f5es realizados no Centro Polit\u00e9cnico voltados \u00e0 comunidade da UFPR, al\u00e9m de outras atividades no HC e na Cl\u00ednica Odontol\u00f3gica do Campus Bot\u00e2nico, com atividades tamb\u00e9m direcionadas aos colaboradores terceirizados da UFPR, alunos da Casa da Estudante Universit\u00e1ria de Curitiba e apoio \u00e0 realiza\u00e7\u00e3o de atividades do NC-UFPR. Foram montados postos de coleta de saliva tamb\u00e9m nos campi de Palotina, Toledo, Litoral e Jandaia do Sul. As amostram eram enviadas a Curitiba via Central de Transportes da UFPR. Ao todo, foram realizados mais de 50 mil exames com 4.381 casos positivos.<\/p>\n
A demanda variou, com momentos de picos na chegada de novas variantes. Mesmo com a diminui\u00e7\u00e3o da preocupa\u00e7\u00e3o com a Covid-19 em 2022, a equipe continuou oferecendo os testes durante todo aquele ano. Em 2023, em raz\u00e3o da baixa procura, o servi\u00e7o de diagn\u00f3stico em massa da UFPR foi encerrado no final de mar\u00e7o. Por\u00e9m, a equipe mant\u00e9m o atendimento de um n\u00famero menor de testes para diagn\u00f3stico de SARS-CoV-2 e Influenza, dentro de projeto de pesquisa para vigil\u00e2ncia desses v\u00edrus.<\/p>\n
![\"N\u00famero](\"https:\/\/blogmed.antonini.com.br\/wp-content\/uploads\/2023\/05\/numero-de-exames-1024x834-1.jpg\")
N\u00famero de exames e casos positivados por m\u00eas. Gr\u00e1fico por Juliana Barbosa.<\/p><\/div>\n
Parcerias fundamentais<\/strong><\/p>\n Muitas pessoas estiveram envolvidas nesse projeto. A for\u00e7a-tarefa contou com estagi\u00e1rios de gradua\u00e7\u00e3o (Cibele Batina Rabelo, Guilherme Antonio Vendramin, Let\u00edcia Dalla Vechia Henschel, Nathalie Carla Cardoso, Thiago Nery de Menezes, Bruna Estelita Ruginsk de Vasconcelos Lima da Silva, Eliza Piccoli, Marcela Santa Clara Brito, Clayton Voidelo Machado e Camila Lais Gon\u00e7alves Ribeiro), residentes m\u00e9dicos veterin\u00e1rios (Luiz Fernando Cardoso Garcia, Altina Bruna de Souza Barbosa, Maiara Paifer e Diego C\u00e2ndido de Abreu), uma volunt\u00e1ria (Anahi Chechia do Couto), bolsistas entre graduandos, mestrandos, doutorandos e p\u00f3s-doutorandos (Beatriz Bocatte de Mattos, Bruna da Silva Soley, Carla Adriane Royer, Cristina Kaehler, Diego Candido de Abreu, Helyn Priscila de Oliveira Barddal, Madson Silveira de Melo, Rachel dos Santos de Sena de Vasconcelos, Priscila Ikeda, Carla Juliana Ribeiro Dolenga, Juliana Nogueira Maximiano, Rafaela Nasser Veiga, Vitor Alan Debacker, Jhonn Willian dos Santos , Mariana Satiko Pastore Saito, Felipe Matheus da Silva, Aline Chrystie de Freitas, Leticia Portela Pereira, Marco Steiner Sand, Yasmin Cristina Otto dos Santos, Hellen Abreu, Carolina Gracia Poitevin, Hilda Vanessa Poquioma Hernandez e Ryu Masaki), al\u00e9m dos docentes do Departamento de Gen\u00e9tica, Jaqueline Carvalho de Oliveira, Douglas Adamoski, Daniela Fiori Gradia, Ana Claudia Bonatto e Roseli Wassen, do Prof. Dieval Guizelini (SEPT), dos diretores do SCB, Edvaldo da Silva Trindade, Emanuel Maltempi de Souza, Thales Ricardo Cipriani e Marcelo de Meira Santos Lima, e de uma grande quantidade de volunt\u00e1rios (professores, t\u00e9cnicos-administrativos, estudantes e terceirizados) que colaboraram nos mutir\u00f5es. Um bra\u00e7o do projeto, coordenado pelo Prof. Dr. Alexander Welker Biondo, formado por estudantes volunt\u00e1rios, se deslocava para realizar coletas em grupos de vulnerabilidade social, como popula\u00e7\u00e3o carcer\u00e1ria, pessoas em situa\u00e7\u00e3o de rua e ind\u00edgenas.<\/p>\n O projeto contou ainda com o apoio das equipes do Casa 3 e do N\u00facleo de Ensino, Pesquisa e Extens\u00e3o em Sa\u00fade (Nepes) coordenado pela Profa. Daiane Kloh, que fizeram o rastreamento e o monitoramento de integrantes da comunidade acad\u00eamica infectados com o Sars-CoV-2 e at\u00e9 mesmo de pessoas que tiveram resultado negativo, mas que apresentavam sintomas compat\u00edveis com os da Covid-19.<\/p>\n O Prof. Douglas Adamoski, Professor substituto na UFPR \u00e0 \u00e9poca e atualmente pesquisador no Laborat\u00f3rio Nacional de Bioci\u00eancias (LNBio) em Campinas-SP, foi um dos personagens essenciais desse projeto. Al\u00e9m de participar das testagens em todas as fases, montou no laborat\u00f3rio as fun\u00e7\u00f5es automatizadas para gera\u00e7\u00e3o de laudos. Ap\u00f3s a confer\u00eancia dos resultados, os laudos eram inseridos no sistema, encerrando o trabalho manual. Desse ponto em diante, tudo era automatizado: o laudo e o atestado do m\u00e9dico seguiam para o e-mail das pessoas de forma autom\u00e1tica, assim como as informa\u00e7\u00f5es inseridas nas plataformas obrigat\u00f3rias (Gal e Notifica). \u201cIsso agilizou muito todo o trabalho e permitiu ampliar o n\u00famero de atendimentos. Os grandes mutir\u00f5es de coleta s\u00f3 foram poss\u00edveis com a automatiza\u00e7\u00e3o dos dados\u201d, afirma a Profa. Ana Claudia Bonatto.<\/p>\n \u201cMesmo sendo um per\u00edodo de grande incerteza e receio, com o ac\u00famulo das atividades did\u00e1ticas remotas e produ\u00e7\u00e3o de material de divulga\u00e7\u00e3o cient\u00edfica, a for\u00e7a tarefa do SCB se mostrou uma excelente oportunidade de auxiliar e mostrar \u00e0 sociedade o potencial do Setor e da UFPR e colaborar em emerg\u00eancias como a da Covid-19.\u201d <\/em>\u2014- Prof. Douglas Adamoski<\/p>\n Al\u00e9m do LIGH, tiveram participa\u00e7\u00e3o no projeto o Laborat\u00f3rio de Citogen\u00e9tica Humana e Oncogen\u00e9tica (LABCHO), tamb\u00e9m do Departamento de Gen\u00e9tica, atuando na realiza\u00e7\u00e3o dos exames, e o Laborat\u00f3rio de Fixa\u00e7\u00e3o Biol\u00f3gica de Nitrog\u00eanio, do Departamento de Bioqu\u00edmica e Biologia Molecular, realizando a genotipagem de SARS-CoV-2 por sequenciamento. E a equipe do Laborat\u00f3rio de Virologia do HC, incluindo as Professoras Sonia Raboni e Meri Bordignon Nogueira, ajudou na padroniza\u00e7\u00e3o da testagem e continua fornecendo suporte.<\/p>\n N\u00e3o menos importante foi a contribui\u00e7\u00e3o de v\u00e1rios grupos de pesquisa fornecendo ou emprestando materiais para a estrutura\u00e7\u00e3o do laborat\u00f3rio: do Departamento de Zoologia veio o rob\u00f4 de pipetagem para montagem das placas, cedido pelo Prof. Walter Boerger; do Setor de Tecnologia (Prof. S\u00e9rgio Braga) por meio de um termociclador; da Farmacologia, um nobreak; entre outros. Alguns laborat\u00f3rios contribu\u00edram com materiais de consumo como luvas e tubos para coleta quando estes estavam em falta no mercado. Recebemos tamb\u00e9m doa\u00e7\u00f5es de material (\u00e1lcool em gel, luvas, m\u00e1scaras etc.) de servidores e da popula\u00e7\u00e3o. A maior parte do financiamento dos testes foi realizada pela UFPR com recursos do Minist\u00e9rio da Educa\u00e7\u00e3o (MEC) e do Minist\u00e9rio da Ci\u00eancia e Tecnologia para combate \u00e0 Covid-19, do Projeto Rede de Laborat\u00f3rios de Campanha (Rede V\u00edrus\/MCTI\/FINEP) e da Rede Paranaense de Testagem (SETI-PR) para aquisi\u00e7\u00e3o de material de consumo e EPIs. Recebemos ainda doa\u00e7\u00e3o de kits de RT-qPCR para diagn\u00f3stico de Covid-19 do Instituto de Biologia Molecular do Paran\u00e1 (IBMP).<\/p>\n A Pr\u00f3-Reitoria de Planejamento, Or\u00e7amento e Finan\u00e7as da UFPR (PROPLAN) teve participa\u00e7\u00e3o fundamental no sucesso do projeto, disponibilizando bolsas de gradua\u00e7\u00e3o e p\u00f3s-doutorado. Num momento em que a pandemia tinha diminu\u00eddo e, consequentemente, o n\u00famero de volunt\u00e1rios tamb\u00e9m, \u201ca Universidade entendeu que era importante manter a seguran\u00e7a, principalmente com o retorno das aulas. Foi criada uma comiss\u00e3o de enfrentamento da Covid-19 e, para o retorno das aulas presenciais, foram lan\u00e7ados alguns editais para ajudar nesse retorno seguro, como o da equipe que fez o aplicativo Check UFPR, o da equipe que analisava os espa\u00e7os, entre outros\u201d, exemplifica o Prof. Emanuel Maltempi, presidente da comiss\u00e3o de enfretamento da Covid-19 na institui\u00e7\u00e3o.<\/p>\n O projeto teve apoio constante da Reitoria da UFPR. Al\u00e9m disso, o Governo do Estado tamb\u00e9m deu suporte, custeando bolsas. Outros parceiros tamb\u00e9m contribu\u00edram, incluindo grupos da Enfermagem, do Curso de Farm\u00e1cia, da P\u00f3s-gradua\u00e7\u00e3o em Bioinform\u00e1tica, da Odontologia, do Setor de Ci\u00eancias da Sa\u00fade e dos quatro cursos do SCB (Biomedicina, Ci\u00eancias Biol\u00f3gicas, Educa\u00e7\u00e3o F\u00edsica e Fisioterapia).<\/p>\n Legado do projeto de testagem<\/strong><\/p>\n Uma UFPR mais bem preparada, olhando sempre para a comunidade a fim de oferecer servi\u00e7os de qualidade, com todo o rigor de laborat\u00f3rios de diagn\u00f3sticos. Uma UFPR ainda mais colaborativa internamente, com a uni\u00e3o de v\u00e1rios grupos e compartilhamento de estruturas e equipamentos, fortalecendo-se conjuntamente. Uma UFPR ainda mais aberta a trocas de expertise e experi\u00eancias entre institui\u00e7\u00f5es diversas, protagonista de grandes avan\u00e7os cient\u00edficos. S\u00e3o incalcul\u00e1veis os legados deixados por esse projeto.<\/p>\n Fica tamb\u00e9m como importante legado a implementa\u00e7\u00e3o do Laborat\u00f3rio NB-3 e do Biot\u00e9rio NB-3, poss\u00edvel, em partes, gra\u00e7as \u00e0s parcerias e compet\u00eancias estabelecidas durante o desenvolvimento do projeto de coleta.<\/p>\n A atual Dire\u00e7\u00e3o do Setor de Ci\u00eancias Biol\u00f3gicas aponta que este foi o maior projeto de extens\u00e3o que a UFPR j\u00e1 realizou (mesmo sem ter sido assim classificado), pois \u201cimpactou direta e extensivamente a comunidade paranaense no momento mais cr\u00edtico da pandemia, gra\u00e7as ao desenvolvimento cient\u00edfico, capacidade de resposta, e pessoal altamente qualificado que s\u00f3 a universidade p\u00fablica brasileira consegue mobilizar. Estamos orgulhosos dos resultados e sabemos que a popula\u00e7\u00e3o reconhece a relev\u00e2ncia e impacto que produzimos\u201d, diz Prof. Thales Cipriani.<\/p>\n Para o Reitor da UFPR, Prof. Dr. Ricardo Marcelo Fonseca, \u201cesse programa de testagem que o Setor de Ci\u00eancias Biol\u00f3gicas levou adiante durante boa parte do ciclo da pandemia, com o apoio da Reitoria, foi essencial para a nossa comunidade. Foi um exemplo de como as compet\u00eancias desse Setor s\u00e3o colocadas a servi\u00e7o da ci\u00eancia e tamb\u00e9m da sa\u00fade dos integrantes da fam\u00edlia UFPR\u201d.<\/p>\n O que esperar do Sars-Cov agora?<\/strong><\/p>\n \u201c<\/strong>Essa \u00e9 uma pergunta dif\u00edcil de responder, porque j\u00e1 tivemos tantas surpresas\u2026 J\u00e1 t\u00ednhamos programado a parada dos exames em dezembro de 2021, quando tivemos apenas um \u00fanico caso positivo. No entanto, em janeiro surgiu a variante \u00d4micron e foi aquela explos\u00e3o de casos\u201d, lembra a Profa. Jaqueline. Ela alerta que precisamos manter a vigil\u00e2ncia, pois nada garante que n\u00e3o aparecer\u00e3o outras variantes que causem aumento de transmiss\u00e3o e que possam ser at\u00e9 mais graves. \u201cPrecisamos monitorar, acompanhar e estarmos preparados caso eventualmente venha a aparecer uma outra variante do Sars-Cov ou de outro v\u00edrus qualquer\u201d, adverte.<\/p>\n Apesar de estarmos num momento de baixa procura por testes, ainda h\u00e1 casos positivos sendo diagnosticados. Em mar\u00e7o, tiveram 22 casos. \u201cPara manter a vigil\u00e2ncia bem como as an\u00e1lises de variantes e a busca por novas variantes, pretendemos continuar com alguns testes dentro de projetos de pesquisa, liberando algumas vagas para a comunidade duas vezes por semana\u201d, salienta a coordenadora do projeto.<\/p>\n Caminhos da pesquisa<\/strong><\/p>\n O SCB deve inaugurar em breve o Laborat\u00f3rio NB-3, espa\u00e7o controlado e periodicamente certificado, fundamental para testar propostas de tratamento e desenvolver vacinas. Por ter isolamento do ar em rela\u00e7\u00e3o ao ambiente externo e veda\u00e7\u00e3o perfeita, nele ser\u00e1 poss\u00edvel fazer cultura do v\u00edrus vivo, conseguindo multiplic\u00e1-lo a fim de estudar estrat\u00e9gias para extermin\u00e1-lo. \u201cFomos muito bem at\u00e9 o diagn\u00f3stico. Para o segundo passo, precis\u00e1vamos dessa estrat\u00e9gia\u201d, explica a Prof. Jaqueline. O NB-3 \u00e9 um laborat\u00f3rio multiusu\u00e1rio, ou seja, poder\u00e1 ser utilizado por qualquer pesquisador, inclusive de outras universidades e institui\u00e7\u00f5es, ap\u00f3s passarem por um treinamento.<\/p>\n O trabalho de rastreamento deve continuar com foco nas an\u00e1lises de Covid e tamb\u00e9m de Influenza pela saliva, bem como na verifica\u00e7\u00e3o de outros v\u00edrus respirat\u00f3rios. \u201cEstamos esperando um kit chegar para analisarmos um painel de 12 v\u00edrus respirat\u00f3rios\u201d. A estrutura desenvolvida nesse ciclo servir\u00e1 tamb\u00e9m para diagn\u00f3sticos moleculares associados, por exemplo, ao c\u00e2ncer. \u201cAlgumas an\u00e1lises gen\u00e9ticas s\u00e3o importantes para o m\u00e9dico diagnosticar melhor a doen\u00e7a e decidir qual o tipo de tratamento mais adequado para cada caso\u201d, explica a Profa. Jaqueline.<\/p>\n Atendimento \u00e0 popula\u00e7\u00e3o<\/strong><\/p>\n O esquema de testagem em massa foi encerrado no dia 31 de mar\u00e7o, mas manter a vigil\u00e2ncia do v\u00edrus, variantes e subvariantes \u00e9 necess\u00e1rio, por isso o atendimento \u00e0 comunidade continua. Em casos de sintomas respirat\u00f3rios, a recomenda\u00e7\u00e3o \u00e9 que a pessoa diminua o contato com outras pessoas, principalmente com as de maior suscetibilidade a doen\u00e7as graves e idosos, retome o uso da m\u00e1scara e realize o RT-qPCR.<\/p>\n Est\u00e3o sendo disponibilizadas 100 vagas a toda comunidade, membros da UFPR e externos, nas segundas e quintas-feiras, das 9h \u00e0s 9h30. O agendamento deve ser feito pelo site <\/a>e a coleta \u00e9 realizada no estacionamento do Setor de Ci\u00eancias Biol\u00f3gicas (Centro Polit\u00e9cnico). Os participantes recebem por e-mail o resultado do exame.<\/p>\n Por Danielle Salm\u00f3ria (Aspec\/SCB)<\/em><\/p>\n Mat\u00e9ria aqui<\/a><\/p>\n